El caso cobró una gran trascendencia pública sin precedentes en la historia del periodismo argentino y la familia pasó de ser denunciante a denunciada. El fiscal intensificó la investigación sobre el esposo de la víctima, Carlos Carrascosa, y el resto de la familia como posibles encubridores del asesinato.
El 11 de julio de 2007 Carlos Carrascosa fue condenado a cinco años y seis meses de prisión como encubridor del hecho. Sin embargo, 38 días después y tras pagar una fianza de 25.000 dólares fue puesto en libertad. Casi dos años más tarde, concretamente el 18 de junio de 2009, la Cámara de Casación de la provincia de Buenos Aires modificó los cargos contra Carrascosa y lo condenó a prisión perpetua por considerarlo "autor material" del crimen en lugar de "encubridor".
A su vez, el 18 de mayo de 2011, comenzó el juicio relacionado con el encubrimiento del asesinato. Entre los procesados se encontraban varios familiares de María Marta: Guillermo Bártoli (cuñado), Horacio Carlos García Belsunce (hermano), Sergio Binello (amigo), Juan Carlos Hurtig (hermanastro), Beatriz Michelini (masajista) y Juan Ramón Gauvry Gordon (médico).